・nginxのerror.logによれば…

3230#0: *2 open() "/var/lib/nginx/tmp/client_body/0000000001" failed (13: Permission denied), client: *.*.*.*, server: www.elmii.jp, request: "POST /mirarepo/xmlrpc.php HTTP/1.1", host: "www.elmii.jp"

・テンポラリディレクトリのパーミッションでした。
・正確にはパーミッションではなくオーナー権限の問題でした。
・nginxはユーザーapacheで動かしていたので、オーナーが違っていました。
・/var/lib/nginx以下のオーナーをapacheに変更して解決。

【追記】

nginxの実行ユーザーをapacheにしてしまうとどうも都合が悪いようなので、nginxに揃えました。。